La Ilustre Municipalidad de Copiapó es dirigida por el Alcalde, que es su gestor, y un Concejo Municipal, que cumple un rol fiscalizador y normativo.
En las elecciones municipales realizadas en octubre de 2008, los habitantes de la comuna eligieron por un nuevo período como Alcalde a don Maglio Cicardini Neyra.
El actual período alcaldicio se extiende hasta diciembre de 2012.